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細胞シミュレーションのための計算科学的手法−反応ネットワークから一分子粒度
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JPY
Abstract
◎細胞の応答や機能は,細胞内の生化学反応系の振る舞いにより制御されている.近年の分子生物学の発展により細胞内反応系を構築する化学種(蛋白質)が同定され,膨大な数の化学種が複雑なネットワークを構築していることが明らかとなった.このような反応系の振る舞いの破綻は疾病に結びつくため,この機序を理解することは非常に重要である.計算機シミュレーションは大規模かつ複雑なネットワークの振る舞いを理解するのに適しており,生化学反応系の計算機シミュレーションは古くより行われてきた.本稿では,細胞内反応系をシミュレーションするための数理的枠組み,従来のシミュレーション技法,そして最先端のシミュレーション技法である一分子粒度計算について著者らの研究を交えて解説し,その有用性や今後の展望について考察する.
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