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腫瘍特異的ネオ抗原の数理的解析とがんの免疫病態解明への応用
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JPY
Abstract
次世代シークエンサーの発展により,シークエンス解析は,がん研究において標準的な解析手法となった.さらに近年では研究を超えて,実際の臨床現場において,腫瘍が有する体細胞変異を同定することで,治療における指針のひとつとして用いられるようにもなっている.本稿では,近年注目を集めているがんの免疫療法に関する基本的な話題を紹介したうえで,筆者らの研究テーマのひとつである,シークエンスの結果を数理的に解析することでがんの免疫病態解明をめざす研究を紹介する.ここでは,ネオ抗原(NeoAg)といわれる,近年活発に研究が行われている腫瘍特異的抗原に焦点を当て,NeoAg のがん免疫システムにおける役割と,同定された体細胞変異の情報からNeoAg を予測するための具体的な解析手順を説明したうえで,筆者らの考案したがんの免疫病態の評価指標であるImmuno-editing Inde(IEI)の概念を解説し,IEI を用いた実際の解析結果に関して紹介する.
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